小干扰RNA
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小干扰RNA（Small interfering RNA；siRNA）有时称为短干扰RNA（short interfering RNA）或沉默RNA（silencing RNA），是长度20到25个核苷酸的双股RNA，在生物学上有许多不同的用途。目前已知siRNA主要参与RNA干扰（RNAi）现象，以带有专一性的方式调节基因的表达。此外，也参与一些与RNAi相关的反应途径，例如抗病毒机制或是染色质结构的改变。不过这些复杂机制的反应途径目前尚未明了。
siRNA最早是由英国的大卫·包孔博（David Baulcombe）团队发现，是植物中的后转录基因沉默（post-transcriptional gene silencing；PTGS）现象的一部分[1]，其研究结果发表于《科学》[2]。2001年，汤玛士·涂许尔（Thomas Tuschl）团队发现合成的siRNA，可诱导哺乳动物体内的RNAi作用[3]，结果发表于《自然》[4]。这项发现引发了利用可控制的RNAi，来进行生物医学研究与药物开发的方法。
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结构
siRNA通常是一段长21个核苷酸的双股RNA（dsRNA），其两股分别在RNA的两端超出另一端2个核苷酸，图示如下：
每一股各有一个5'磷酸基末端与一个3'羟基末端。此结构经dicer作用而得，dicer这种酶将较长的双股RNA或小发夹RNA（small hairpin RNA）切成siRNA[5]。此外，siRNA也可经由多种不同转染（transfection）技术导入细胞内，并对特定基因产生具专一性的基因剔除（knockdown）效果。本质上，任何已知序列的基因都可以、也因此是经过适当剪裁而具有序列互补性的siRNA的作用对象。这使siRNA成为研究基因功能与药物目标的一项重要工具。
参见
- 微RNA（miRNA）
参考文献
- ↑ Hamilton A, Baulcombe D. A species of small antisense RNA in posttranscriptional gene silencing in plants. Science. 1999, 286 (5441): 950-2. PMID 10542148.
- ↑ Hamilton A, Baulcombe D. A species of small antisense RNA in posttranscriptional gene silencing in plants. Science. 1999, 286 (5441): 950-2. PMID 10542148.
- ↑ Elbashir S, Harborth J, Lendeckel W, Yalcin A, Weber K, Tuschl T. Duplexes of 21-nucleotide RNAs mediate RNA interference in cultured mammalian cells. Nature. 2001, 411 (6836): 494-8. PMID 11373684.
- ↑ Elbashir S, Harborth J, Lendeckel W, Yalcin A, Weber K, Tuschl T. Duplexes of 21-nucleotide RNAs mediate RNA interference in cultured mammalian cells. Nature. 2001, 411 (6836): 494-8. PMID 11373684.
- ↑ Bernstein E, Caudy A, Hammond S, Hannon G. Role for a bidentate ribonuclease in the initiation step of RNA interference. Nature. 2001, 409 (6818): 363-6. PMID 11201747.
概观：
- Hannon G, Rossi J. Unlocking the potential of the human genome with RNA interference. Nature. 2004, 431 (7006): 371-8. PMID 15372045.
- Fire A, Xu S, Montgomery M, Kostas S, Driver S, Mello C. Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans. Nature. 1998, 391 (6669): 806-11. PMID 9486653. The original paper by Fire et al. describing RNAi
- Elbashir S, Lendeckel W, Tuschl T. RNA interference is mediated by 21- and 22-nucleotide RNAs. Genes Dev. 2001, 15 (2): 188-200. PMID 11157775.
- Zamore P, Tuschl T, Sharp P, Bartel D. RNAi: double-stranded RNA directs the ATP-dependent cleavage of mRNA at 21 to 23 nucleotide intervals. Cell. 2000, 101 (1): 25-33. PMID 10778853.
- Hamilton A, Baulcombe D. A species of small antisense RNA in posttranscriptional gene silencing in plants. Science. 1999, 286 (5441): 950-2. PMID 10542148. First description of siRNAs.
非专一性效用：
- Zhang Z, Weinschenk T, Guo K, Schluesener H. siRNA binding proteins of microglial cells: PKR is an unanticipated ligand. J Cell Biochem. 2006, 97 (6): 1217-29. PMID 16315288.
- Kim D, Behlke M, Rose S, Chang M, Choi S, Rossi J. Synthetic dsRNA Dicer substrates enhance RNAi potency and efficacy. Nat Biotechnol. 2005, 23 (2): 222-6. PMID 15619617.
- Sledz C, Williams B. RNA interference and double-stranded-RNA-activated pathways. Biochem Soc Trans. 2004, 32 (Pt 6): 952-6. PMID 15506933.
- Pebernard S, Iggo R. Determinants of interferon-stimulated gene induction by RNAi vectors. Differentiation. 2004, 72 (2-3): 103-11. PMID 15066190.
- Sledz C, Holko M, de Veer M, Silverman R, Williams B. Activation of the interferon system by short-interfering RNAs. Nat Cell Biol. 2003, 5 (9): 834-9. PMID 12942087.
外部连结
- 设计与定性工具：
- Deqor: A web-based tool for the design and quality control of siRNAs
- siDirect: a web-based online software system for designing siRNA sequences
- siSearch: a siRNA design tool using a number of popular design methods
- SpecificityServer: a tool for checking the specificity of a given siRNA
- miRacle: tool for prediction of siRNA and microRNA targets using an algorithm which incorporates RNA secondary structure
- 数据库：
- siRNA关联企业
- Alnylam Pharmaceuticals
- Anadys Pharmaceuticals
- ArmaGen Technologies,Inc
- Benitec
- BD Biosciences
- Bionomics
- BioSpring
- Celera Genomics
- Cenix BioScience
- Ceptyr
- Finnzymes Oy
- Ingenium Pharmaceuticals
- Isis Pharmaceuticals
- Nucleonics Inc
- Pfizer Inc
- RNAi Co.Ltd
- Sigma-Aldrich
- Sirna Therapeutics, Inc.
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参考来源
出自A+医学百科 “小干扰RNA”条目 http://www.a-hospital.com/w/%E5%B0%8F%E5%B9%B2%E6%89%B0RNA 转载请保留此链接
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