根
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根(root)，维管植物体轴的地下部分，主要起固着和吸收作用，同时还有合成和贮藏有机物质，以及进行营养繁殖的功能。根上不生长叶和花，它虽然和茎一样有分枝，但分枝（侧根）来源不同。藻类和苔藓植物没有根，蕨类植物中最原始的松叶蕨、梅西蕨和古代最早的陆生化石莱尼蕨也没有真正的根，只在地下的根状茎上有具吸收功能的假根；大多数现存的蕨类植物、裸子植物和被子植物才有真正根的结构。
根系 一株植物全部根的总称。种子萌发后，由胚根发育的根，称为主根，大多数裸子植物和双子叶植物的主根继续生长，明显而发达。由主根及各级侧根组成的根系，称为直根系。单子叶植物的主根在生长一个短时期后，即停止生长而枯萎，并由茎基部节上产生大量不定根，这些不定根也能继续发育，形成分枝，整个根系形如须状，故称须根系。大多数蕨类植物的根系，也是由不定根所组成，这些不定根从茎、根状茎发育而来。
根系在土壤中伸展的范围及根量的多少，与植物种类和外界环境，如土壤的结构、通气程度以及水分状况等有关。一般直根系伸入土壤的深度，大于须根系。大多数木本植物的主根深达10～12米，某些生长在干旱沙漠地区的植物，如骆驼刺的根系可伸入土层达20米左右。禾本科植物的须根系入土较浅，一般仅20～30厘米。木本植物根系在土壤中的伸延范围，直径可达10～18米，常超过树冠的好几倍；草本植物如南瓜为6～8米；禾谷类植物仅40～60厘米。
俗话说的“根深叶茂”，“本固枝荣”等，都说明植物地下部分的根系，与地上部分的茎、叶等器官的生长密切相关。在农业生产上，常用控制水、肥及光照强度来调整作物的根冠比，即根系的干重或鲜重与地上部分的干重或鲜重之比，以达到作物丰产的目的。
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根端
根和茎一样，顶端有分生组织。但两者的顶端结构各有其特点。在根的最顶端，有一套在顶端分生组织外面的帽状结构- 根冠。当根端向土壤深处生长时，根冠的薄壁组织细胞不断受到磨损和脱落，同时新的根冠细胞又不断地从顶端分生组织产生，使其补充而仍旧保持原状。另外，根冠外层细胞壁的高度粘液化，往往也可减少根与土壤颗粒之间的摩擦。根冠还是控制根部向地性的一种组织，是感受重力的部位。有人认为根冠细胞中所含的造粉体，是一种重力感受器。一般认为内质网和高尔基器也参与了根部向地性的作用。
根端的顶端分生组织细胞，在各类植物中不同。有的只有一个原始细胞（如一些蕨类植物）；有的为两层或3层原始细胞(如大多数裸子植物和被子植物)(见顶端分生组织)。这些顶端分生组织细胞进行细胞分裂，增加细胞数目。在距顶端较远的一些细胞，生长、分化，因而使根向顶端方向伸长。当细胞成熟时，根表面的一层细胞（表皮细胞）有的壁向外突起，形成根毛。根毛的形成，标志着根的成熟，故将这一区域叫做成熟区或根毛区，细胞正在伸长的区域叫伸长区，顶端部分称为分生区。
初生结构 根毛区的细胞已大部成熟，并分化成各类组织，组成根的初生结构。在根的外表是由一层细胞组成的表皮层。在幼小根中，表皮由一层排列紧密的薄壁组织细胞所组成，外壁常覆盖有薄的角质层。在大多数老根中，表皮均已脱落，某些多年生草本植物根的表皮层也可长期保存，其细胞壁明显增厚和角质化。生长在热带地区的兰科植物，或附生的天南星科植物所具有的气生根，常发育成几层细胞厚的复表皮，或称根被，可防止气生根中水分的过度丧失。
表皮层上的根毛，是表皮细胞壁向外突起所形成的，一般长0.05～10毫米。表皮细胞中的原生质体与根毛相通。随着根端不断向顶端伸长，老的根毛逐渐丧失功能而萎缩，其寿命一般仅有15～20天，即由前端新产生的根毛所代替。根毛具有增加根部吸收面积的作用。
表皮层以内为皮层，它是由薄壁组织细胞所组成，细胞排列疏松，具胞间隙，尤其是生长在潮湿或水生条件下的植物，如水稻等，胞间隙常可发展成大的溶生腔，起通气作用。皮层最外一层或几层细胞，其细胞排列整齐，无胞间隙，细胞壁栓质化或硬化，称外皮层。常见于许多单子叶植物，主要起保护作用。皮层的最内一层细胞为内皮层，细胞排列紧密，无胞间隙，其径向壁与横向壁上具栓质的带状加厚，即凯氏带。在具次生生长的根中，内皮层与皮层一起随之脱落。在单子叶植物根中，内皮层细胞也可发育出增厚的次生壁，而对着原生木质部脊的内皮层细胞，有的仍为薄壁和具凯氏带，称通道细胞。
根的中央部分是由维管组织和薄壁组织组成的维管柱。它包括中柱鞘及维管组织两部分。中柱鞘在维管组织的外面，常作为中柱的分界层；它由一层或几层薄壁组织细胞连续排列构成；有的也含有厚壁组织；中柱鞘仍保留有分生能力，它是侧根、维管形成层及木栓形成层的发源地。根的维管组织排列与茎不同，初生木质部和初生韧皮部并不排在同一半径方向上，而是两者呈辐射状的相间排列。其中木质部常形成实心的中央柱，但在许多单子叶植物中，根的中心没有木质部，而是由薄壁组织或厚壁组织组成的髓。在根的横切面上，木质部分子径向排列形成的脊，在各种植物或同一种植物的不同根中，数目不同。根据根中脊的数目，可分别称为二原型、三原型、四原型、五原型和多原型。大多数蕨类植物为二原型或三原型，单子叶植物根中木质部脊的数量通常多于双子叶植物。从根的横切面看，初生木质部和初生韧皮部的分化顺序，都是由外向心的分化，即早分化的原生木质部与原生韧皮部，都发生在中柱鞘的附近，而后生木质部和后生韧皮部则深入到柱心分化。这种向心分化的方式，称为外始式。
侧根与不定根的形成 根的分枝与茎不同，茎的分枝，早在茎端上已形成原基，而根的分枝（侧根）是由根的内部组织形成，故称为内起源。在种子植物中，侧根都是从中柱鞘的细胞形成的。其发生过程是：在离根端向后一段距离的中柱鞘细胞中，开始出现平周与垂周分裂，形成侧根原基，随后象母根一样，发育出根冠、顶端分生组织及初生结构等。幼小的侧根穿过母根的皮层，一直伸出表面，其中侧根分化出的维管组织也与母根联系在一起。
侧根发生的位置常有一定的规律，如在二原型根中，侧根产生于韧皮部与木质部之间的部位；三原型与四原型是对着木质部的地方；在多原型根中，侧根则对着韧皮部发生，不过在有些多原型根中，也有对着木质部发生的。
通常主根对侧根的生长有一定的抑制作用，特别是在根端附近更为明显。假若将主根的根端除去，则侧根迅速长出。在园艺和蔬菜栽培上，常采用幼苗移栽的办法，就是将伸展到耕作层以下的主根切断，促使大量侧根的发生，以便在土壤表层吸收更多的水分和养料。
不定根的外形、结构与功能同其他的根没有差别，只是它们的发生部位不是在正常形成侧根的部位，而是从植物体的其他部位，如茎、叶、地下茎及较老的根部产生。另外也可从人工离体培养的组织器官中发生。
不定根一般由靠近维管组织周围的束间薄壁组织发生。在老的木本茎中，不定根原基则起源于靠近形成层的射线细胞，甚至有的直接从形成层产生。在插条、植物受伤部位或离体组织、器官培养中，不定根通常从愈伤组织中发生。
在林业和园艺上，对柳树、杨树、葡萄、月季和秋海棠等植物的枝条扦插、叶插或压条等无性繁殖中，均能产生大量不定根。但也有些植物在同样条件下不易形成不定根，如用赤霉素等植物激素处理后，仍可诱导出不定根来。在植物细胞，组织或器官的离体培养中，应用吲哚乙酸、萘乙酸和2，4-D等植物生长调节物可诱导不定根的发生，以获得完整的再生植株。
次生结构 有些植物（如单子叶植物）初生结构形成以后不再生长，而裸子植物和大多数双子叶植物，在初生结构形成以后，由于形成层和木栓形成层的活动，产生次生结构，使根加粗，也称为次生生长。
在有次生生长的根中，初生韧皮部的内侧最初进行平周分裂，形成短的形成层弧段；接着在初生木质部脊外面的中柱鞘细胞也进行平周分裂，由中柱鞘的内层细胞分化为形成层，并与韧皮部内侧的形成层弧段相连，在横切面上，形成凹凸不平的多角形。由于韧皮部内侧的形成层活动最早，向内产生的大量次生木质部，使形成层向外推移，最后在根的横切面上，形成层变成圆环状的一圈。由形成层细胞的平周分裂，向外产生次生韧皮部，向内产生次生木质部，使根的直径不断增粗。在根的次生维管组织中，富含薄壁组织细胞，它们与根部具储藏大量营养物质的功能有关。这也是根与茎在次生结构上明显差别之处。
随着根内形成层的活动，使外面的初生韧皮部及皮层等组织不断受到张力和压力的影响，相继被挤毁或脱落。这时由中柱鞘的外层细胞经平周分裂转变为木栓形成层。木栓形成层向外分裂形成木栓层，向内产生栓内层，这就构成了次生保护组织──周皮。由于根部直径的不断增粗，最初形成的周皮已不能适应而遭破裂，再由里面的次生韧皮部薄壁组织细胞分化出新的木栓形成层。有些植物最初分化的木栓形成层，也可来自表皮下面或皮层最外层的细胞。
变态 有些植物的根，在形态、结构和生理功能上，都出现了很大的变化，这种变化称为变态。变态是长期适应环境的结果，这种特性形成后，相继遗传，成为稳定的遗传性状。常见的变态根有：
肉质根
如萝卜、胡萝卜、甜菜的变态根。它们是由主根以及胚轴的上端等部分膨大形成，在肥大的主根中，薄壁组织细胞内贮存大量养料，可供植物越冬后和次年生长之用。这部分也是食用的部分。这些肉质根虽然外表相似，但内部结构是不同的。在萝卜的肉质根中，大部分为次生木质部，其中具发达的木薄壁组织，储藏着大量的营养物质。胡萝卜肉质根的大部分，属于次生韧皮部，丰富的营养物质储藏在发达的韧皮薄壁组织中。甜菜根除了具正常的次生结构以外，在维管组织的中心外面，由同心圆状排列的形成层产生，它们是从中柱鞘和韧皮部衍生的，形成层能产生出几层维管组织细胞，以及在木质部束和韧皮部束之间，还有大量径向排列的薄壁组织，其发达程度，与甜菜的含糖量有着密切的关系。
块根
植物侧根或不定根膨大而成。这种变态根不象萝卜等，每株只形成一个肉质根，而是一株可以形成许多膨大的块根。常见的如甘薯的块根。它是由茎节间上的不定根所形成，这些不定根先是正常的次生生长，其中次生木质部由大量的木薄壁组织和分散排列的导管所组成，然后在导管周围的一些薄壁组织细胞，恢复分生能力，发育为形成层。形成层活动产生导管、筛管、乳汁管和大量的薄壁组织细胞。
气生根
是生长在空气中的一种变态根，如榕树的枝干上长出许多不定根，可以一直垂入到土壤。此种气生根没有根毛和根冠，不能吸收养分，但能吸收空气中的水分，也有呼吸的功能。由于气生根扎入土内，起了支持作用，使榕树树冠得以发展，故有“独木成林”之感。热带森林中的许多兰科植物也有发达的气生根，它们附生在树的枝干上，靠气生根吸收空气中的水分。气生根因作用不同，又可分为呼吸根、支柱根、攀缘根和吸器。
一些生活在沼泽、海滩的植物，其地下部分生活在缺氧环境中，如落羽杉和海桑树等，在树的主干附近，从土壤或水中伸出许多根来，这些根的结构特殊，内部有许多气道，这种根主要是行呼吸和通气作用，故有呼吸根或通气根之称。
支柱根
最典型的例子是玉米，从茎基部的几个节上长出许多不定根，并向下伸入土中，不仅能吸收水分和无机盐，而且此种根的机械组织发达，能起到稳固茎干的支持作用。
常春藤和凌霄花等植物的细长茎上，生有无数不定根，以其将自身固定在墙壁或其他植物茎干上，这类变态根叫做攀缘根。
营寄生生活的被子植物，如菟丝子，它的茎缠绕在寄主的茎上，并生出许多吸器，吸器伸入寄主茎的内部组织，它们的维管组织与寄主的维管组织相连接，以此可吸收寄主的水分和养料。
菌根和根瘤
许多植物的根系与土壤中的微生物建立了共生关系，在植物体上形成菌根或根瘤。某些种子植物的根与土壤真菌共生所形成的共生体，称为菌根。根据真菌对寄主皮层细胞侵染的情况，又分为两种类型：①外生菌根，真菌形成一鞘层，即菌丝罩，整个包裹着幼根的外部，只有少数菌丝侵入到根皮层的胞间隙中，如松树、栎树等。②内生菌根，真菌形成不明显的罩子，而大部分菌丝均侵入到根部皮层的细胞内部，如兰属、草莓等。菌根真菌的菌丝如同根毛一样，起吸收水分与矿质营养的作用。还能将土壤中的矿质盐和有机物质，转变为易于寄主吸收的营养物质，以及可制造维生素等，供给根系。而寄主植物分泌的糖类、氨基酸及其他有机物质又可供真菌生活，因此两者为共生关系。
豆科植物与根瘤细菌的共生体，即为根瘤。根瘤的维管束与根的维管柱连接，两者可互通营养，一方面豆科植物将水分及营养物质供给根瘤细菌的生长；另一方面根瘤细菌也将固定合成的铵态氮，通过输导组织运送给寄主植物。此外，在植物界中还有一些非豆科植物，如早熟禾属、看麦娘属和胡颓子属等十几个属一百多种植物也能结瘤固氮。
生理功能 根不仅是一个吸收水分与矿质盐的主要器官，而且也是一个转化和合成营养的地方，代谢活动异常活跃。
根对水分的吸收
根系从土壤中吸收水分的最活跃部位，是根端的根毛区(即成熟区)。通常仅由根系的活动而引起的吸水现象，称为主动吸水，而把由地上部分的蒸腾作用所产生的吸水过程，称被动吸水。当植物在蒸腾作用微弱的情况下，主动吸水才是植物吸水的主要原因。土壤水分经根毛和表皮向内扩散的时候，首先从皮层的细胞壁或胞间隙等质外体途径，即“自由空间”通过，到了内皮层，因其细胞的径向壁与横向壁上具栓质的凯氏带，水分不能通过，这时水分只能经由内皮层细胞中的质膜和液泡，即共质体的途径。水分经内皮层细胞进了维管柱以后，则又属质外体的途径，直至木质部的导管。
根对矿质营养的吸收
根系从土壤中吸收矿物质是一个主动的生理过程，它与水分的吸收之间，各自保持着相对的独立性。根部吸收矿质元素最活跃的区域是根冠与顶端分生组织，以及根毛发生区。土壤中的各种离子先吸附在根表面，然后经能量转换与酶的作用，通过细胞质膜进入细胞中，再由细胞间的离子交换、进入维管柱的木质部导管。
根对地上部分生长发育的影响
根系不仅将植物的地上部分牢固地固着在土壤中，从土壤吸收大量水分和矿质营养，供给地上部分生长发育的需要，而且根部还能进行一系列有机化合物的合成转化。其中包括有组成蛋白质的氨基酸，如谷氨酸、天门冬氨酸和脯氨酸等；各类植物激素，如吲哚乙酸、细胞分裂素类，以及少量的乙烯等。根还能从土壤中吸收二氧化碳并固定，借助于特种酶和丙酮酸的作用，转变为苹果酸，然后转运到地上部分，参加叶子的光合作用。
根在其生命活动中，不断向周围环境分泌出许多物质，如氨基酸、磷脂、维生素、有机酸、碳水化合物、单宁、植物碱，以及过氧化物酶、磷酸酯酶、转化酶、淀粉酶、纤维素酶、蛋白酶与脂肪酶等多种胞外酶。此外，根还能分泌二氧化碳、磷、钙、钾、硫等无机物。这些根的分泌物不仅对植物本身具有重要的生理作用，而且对根周围的微生物也有明显的影响。
经济用途 在人类生活中，许多植物的根部已被广泛利用，如甘薯、豆薯、葛藤、木薯等肥大的块根，内含丰富的淀粉，可供人们食用或工业用。萝卜和胡萝卜的根部，是人们常食的蔬菜。甜菜的块根是制糖工业的原料。人参、乌头、甘草、地黄和麦冬等根部是著名的中药材。雷公藤、百部和鱼藤等根部富含生物碱或鱼藤酮，对植物病虫有毒效，可作为防治作物病虫害良好的植物性农药。茜草的根能提取鲜红色的染料，可用于染动植物性纤维及食用色素。
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