持家基因
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持家基因(house-keeping genes):又称管家基因,是指所有细胞中均要表达的一类基因,其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的。如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。
管家基因表达水平受环境因素影响较小,而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续表达,或变化很小。它的表达只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响,而不受其他机制调节。
管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表达,因此管家基因常被用于分子技术--多位点基因分析。一般来说多位点基因分析通常需7个管家基因位点(金黄色葡萄球菌),某些时候可能到10个基因位点(致伤弧菌)。
人类看家基因列表如下(部分基因,最常用的是ACTB和GAPDH,锐博生物),这是Trends in Gentics文献(Human housekeeping genes are compact)上分析得来的。
- NM_001101 Homo sapiens actin, beta (ACTB), mRNA6988
- NM_000034 Homo sapiens aldolase A,fructose-bisphosphate (ALDOA), mRNA3425
- NM_002046 Homo sapiens glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPD), mRNA828
- NM_000291 Homo sapiens phosphoglycerate kinase 1 (PGK1), mRNA2727
- NM_005566 Homo sapiens lactate dehydrogenase A (LDHA), mRNA2105
- NM_002954 Homo sapiens ribosomal protein S27a (RPS27A), mRNA4156
- NM_000981 Homo sapiens ribosomal protein L19 (RPL19), mRNA6997
- NM_000975 Homo sapiens ribosomal protein L11 (RPL11), mRNA6060
- NM_007363 Homo sapiens non-POU domain containing, octamer-binding (NONO), mRNA1708
- NM_004309 Homo sapiens Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) alpha (ARHGDIA), mRNA1358
- NM_000994 Homo sapiens ribosomal protein L32 (RPL32), mRNA9523
- NM_022551 Homo sapiens ribosomal protein S18 (RPS18), mRNA11261
- NM_007355 Homo sapiens heat shock 90kDa protein 1, beta (HSPCB), mRNA4119
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