原肠胚
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胚胎由囊胚继续发育，由原始的单胚层细胞发展成具有双层或三层胚层结构的胚胎，称为原肠胚（或神经胚）。
从扁形动物开始，多细胞动物的胚胎发育过程出现了中胚层，从而引起了身体结构上的复杂分化，这在动物的进化史上是个重大的发展。
原肠胚是由囊胚细胞迁移、转变形成的，它由三层细胞层构成：外胚层(ectoderm)、中胚层(mesoderm)、内胚层(endoderm)。在囊胚不断向内凹陷的过程中，形成外、中、内三个胚层，内胚层中间的空间是原肠腔。外胚层和内胚层最终形成组织的鞘，即上皮(epithelia),覆盖在器官的外表面和内表面。外胚层形成上皮覆盖在外表面(皮肤和腺体)，以及中性组织；内胚层分化成的上皮覆盖在组织的内表面（胃肠和相关的腺体）；中胚层最终发育成扩散的海绵网状间充质细胞（mesenchyme cell），这些细胞形成支持细胞，如肌肉、软骨、骨、血和结缔组织。
在原肠胚中形成的新的细胞关系，激发了细胞；细胞相互作用、代谢的变化、细胞的移动，最终形成组织和器官。
胚胎由囊胚继续发育，由原始的单胚层细胞发展成具有双层或三层胚层结构的胚胎，称为原肠胚（或神经胚）。
除单细胞的原生动物门外，从海绵动物门（最原始、最低等的多细胞生物）在胚胎发育时出现了原肠胚。
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主要特征
体制为两侧对称
两侧对称又叫做左右对称，是通过身体的中轴只有一个切面，能将身体分成左右相等的两个部分。这样，动物的身体就明显地分化出前、后端，左右侧和背腹面。由此又引起功能上的分化：背面主要担负保护作用，腹面主要管运动和摄食，身体的前端为神经系统和感觉器官集中的地方，使动物对外界环境的反应更迅速和准确。两侧对称也使动物的运动从不定向转为定向，既适合于游泳，又适合于在物体上爬行。总之，两侧对称具有重要的进化意义。
出现了中胚层
中胚层的发生，引起了动物身体结构上一系列组织、器官和系统的分化，为动物身体结构的发展和器官功能的进化创造了条件。例如中胚层形成肌肉，增强了动物的运动功能；运动功能的加强和两侧对称的体制的形成，使动物的运动速度提高了；快速运动和感觉器官的完善，又使动物能够有效地摄取更多的食物，从而促进了消化系统的发展和排泄系统的形成。
中胚层还分化形成一种柔软组织，叫做间质（或称为实质）。间质充满在体内各组织、器官之间，以至没有明显的空隙将肠道和体壁分隔开来，所以扇形动物又是无体腔的动物。间质有贮藏水分和养料、输送营养物和排泄物、保护内脏器官以及再生新器官等多种功能。
产生了复杂的器官系统
扁形动物的体壁由表皮和多层肌肉组成，又叫做“皮肤肌肉囊”。这种体壁有保护和运动双重功能。其中，肌肉是由中胚层起源的。由口、咽和肠道组成了不完全消化系统。神经系统中，神经细胞相对集中形成了一对脑神经节和两条腹神经索，加上神经索之间连结的横神经，构成了梯状神经系统。营自由生活的种类常有眼点、平衡囊等感觉器官。排泄系统由焰细胞、排泄管和排泄孔组成，属于原肾型。生殖系统比较复杂，多为雌雄同体，由生殖腺、生殖导管和前列腺、卵黄腺等附属腺体组成。
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