同源异形基因
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同源异形基因(英语:Hox genes)是生物体中一类专门调控生物形体的基因,一旦这些基因发生突变,就会使身体的一部分变形。其作用机制,主要是调控其他有关于细胞分裂、纺锤体方向,以及硬毛、附肢等部位发育的基因。Hox基因属于同源框家族的其中一员,在大多数Hox基因中,会含有一段约180个核苷酸的同源异型盒,可以转录出含有约60个氨基酸序列,称为同源异形域。
Hox基因的特色之一,是其排列顺序与其作用顺序、作用位置相关,例如位在较靠近3'端(DNA的其中一端)的基因,作用的位置较靠近头部。而且动物界中的成员,皆拥有类似的Hox基因排列方式、产物与作用方式。Hox基因对于动物型态的影响,能使演化生物学研究得到关于型态转变的线索。
目录 |
调控型态的方式
各种生物的Hox基因之表现方式类似,靠近3'端的基因会表现于动物的身体前部,靠近5'端则表现于身体的后部。除了这种规律之外,Hox基因又会因为一些原因,而在不同状态下有不同的表现。
当Hox基因下游调控的基因改变时,会使个体产生变异,例如果蝇的平衡杆(halteres)与蝴蝶后翅的差别,就是源于两者的Ubx基因受到的不同调控而产生。在演化的过程中,蜻蜓的Ubx下游基因调控阶层(regulatory hierachy)与原始祖先较为相似,而鳞翅目(如蝴蝶)与双翅目(如果蝇),则改变了一些对下游基因的调控方式。蜻蜓、蝴蝶与果蝇的调控阶层比较如下表,红色字表示受到活化的基因,灰色字表示此类昆虫并不活化此基因:
昆虫种类
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上游Hox基因
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调控阶层
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蜻蜓(蜻蛉目) |
Ubx
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a1 → a2 → a3 b1 → b2 → b3 c1 → c2 → c3 d1 → d2 → d3 |
蝴蝶(鳞翅目) |
Ubx
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a1 → a2 → a3 b1 → b2 → b3 c1 → c2 → c3 e1 → e2 → e3 |
果蝇(双翅目) |
Ubx
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a1 → a2 → a3 b1 → b2 → b3 c2 → c3 → c4 d1 → d2 → d3 |
除了调控方式的差异之外,当Hox基因本身改变,个体发育也会受到影响,例如Ubx基因发生变化时,会影响自身性质,进而影响与其他基因的交互作用,使动物产生不同外型。若是改变Hox基因在某一区域的表现状况,则会使得此区域的发育产生变化,例如当Ubx与Abd-A所表现的蛋白质没有作用时,会使Dll诱导前肢发育。不同区域的Hox基因表现变化,也会导致不同区域发展出不同的构造,例如Ubx与Abd-A在不同部位的交互作用方式差异,是造成不同附肢形成的原因。此外,基因的表现量也会影响发育,例如Hox基因-{}-数目不同的昆虫与脊椎动物之间的差异。
各物种的Hox基因
果蝇
果蝇(这里指黑腹果蝇)的Hox基因皆位在其3号染色体右臂上,可分为两个群集。一群称作双胸复合群(Bithorax complex,BX-C),此群集中的Ubx基因若突变,会使第3胸节(T3)变成第2胸节(T2),而且由于正常状态下的翅膀是长在T2之上,因此这样的突变同时会使果蝇长出两对翅膀,并使原本长在T3上的平衡棒(haltere;双翅目昆虫特有的构造,源自其中一对翅膀)消失。此突变最早是卡耳文·布里吉斯(Calvin Bridges)于1915年发现。
另一群基因则称为触足复合群(Antennapedia complex,ANT-C),此基因群集中的Antp基因发生突变时,会使长在头上的触角替换成第二对腿。另外pb基因的突变,则是会使头上的口器变成腿。
两群基因一开始的研究成果,皆是由观察它们对成虫的影响而得。较晚的研究则发现,对果蝇的幼虫(蛆)来说,BX-C影响了T3到A8部分的发育(果蝇分节:头、T1~T3、A1~A8、性器),其中主要的影响位置是T3到A1。ANT-C则是影响头部以及T1到T2部分。
群集名称
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位置
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基因(名称意义)
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影响位置
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ANT-C | 靠近3'端 | lab(labial;唇) pb(proboscipedia;口器足) Dfd(Deformed;畸形) Scr(Sex combs reduced;性梳减少) Antp(Antennapedia;触足) |
身体前部 |
BX-C | 靠近5'端 | Ubx(Ultrabithorax) AbdA(Abdominal A) AbdB(Abdominal B) |
身体后部 |
人类
人类的Hox基因可分成4个基因群集,分别位在不同的染色体上,这些染色体分别是7号、17号、12号与2号。人类的Hox基因在书写时以全大写表达,例如HOXA、HOXB、HOXC与HOXD。此外,这些基因可分成13个平行同源家族(paralogous family),以数字表示,例如HOXA4,HOXB4,HOXC4与HOXD4。这些家族成员的DNA序列与转录出来的蛋白质序列类似。
其中HOXD13的突变会造成多指症(synpolydactyly);而HOXA13的突变则会导致手脚生殖器症(hand-foot-genital syndrome,HGFS)。另外HOXB群集中的8个成员会影响红血球的发育,其中HOXB4与HOXB7又会影响T细胞与B细胞。
位置
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基因群集
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影响头部
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影响颈部
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影响躯干
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影响四肢
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7号染色体 7p15 ~ p14 |
HOXA | HOXA1 HOXA2 HOXA3 HOXA4 |
HOXA5 HOXA6 |
HOXA7 | HOXA9 HOXA10 HOXA11 HOXA13 |
17号染色体 17q21 ~ q22 |
HOXB | HOXB1 HOXB2 HOXB3 HOXB4 |
HOXB5 HOXB6 |
HOXB7 HOXB8 |
HOXB9 |
12号染色体 12q12 ~ q13 |
HOXC | HOXC4 | HOXC5 HOXC6 |
HOXC8 | HOXC9 HOXC10 HOXC11 HOXC12 HOXC13 |
2号染色体 2q31 ~ q32 |
HOXD | HOXD1 HOXD3 HOXD4 |
HOXD8 | HOXC9 HOXD10 HOXD11 HOXD12 HOXD13 |
老鼠
老鼠的Hox基因特性与人类相似,分别位在6号、11号、15号与2号染色体上,书写时只有首字母大写,例如Hoxa-11与Hoxd-11。
第3平行同源家族,也就是Hoxa-3、Hoxb-3与Hoxd-3基因,主要作用是产生颈部的脊椎骨。另外Hoxa-11或是Hoxd-11其中一的基因发生突变时,会使桡骨(radius)或尺骨(ulna)产生轻微缺陷。若是两个基因同时突变,则会使两块骨头皆退化。
位置
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基因群集
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基因
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6号染色体 | Hoxa | Hoxa-1 Hoxa-2 Hoxa-3 Hoxa-4 |
Hoxa-5 Hoxa-6 |
Hoxa-7 | Hoxa-9 Hoxa-10 Hoxa-11 Hoxa-13 |
11号染色体 | Hoxb | Hoxb-1 Hoxb-2 Hoxb-3 Hoxb-4 |
Hoxb-5 Hoxb-6 |
Hoxb-7 Hoxb-8 |
Hoxb-9 |
15号染色体 | Hoxc | Hoxc-4 | Hoxc-5 Hoxc-6 |
Hoxc-8 | Hoxc-9 Hoxc-10 Hoxc-11 Hoxc-12 Hoxc-13 |
2号染色体 | Hoxd | Hoxd-1 Hoxd-3 Hoxd-4 |
Hoxd-8 | Hoxd-9 Hoxd-10 Hoxd-11 Hoxd-12 Hoxd-13 |
参考文献
- Daniel Hartl & Elizabath W. Jones. Genetic. 6th ed. Jones and Bartlett Publishers. ISBN 0-7637-1511-5
- (中文)大石正道。《图解人类基因组的构造》。林碧清译。世茂出版社。2002年12月。ISBN 957-776-432-0
- (中文)Sean B. Carrol。《蝴蝶斑马与胚胎:探索演化发生学之美》(Endless Forms Most Beautiful: The New Science of Evo Devo)。王惟芬译。商周出版。2006年。ISBN 978-986-124-774-8
- (中文)生命经纬 - ANT-C复合座位的结构和功能
- Brian E. Staveley - Evolution and Development
- (中文)清华大学 - Organogenesis
- (中文)郭晓卉 - 同位序列基因与细胞分化及器官发育
- (中文)清华大学 - Developmental Biology
- Leland H. Hartwell. et al. Genetics - From gene to genome. McGraw-Hill. ISBN 0-07-540923-2
外部连结
- (中文)生物通 - 新发现 Hox基因成簇是多余的?
- (中文)科景 - 生物:一个就够了
- (中文)科景 - 生物:重造热血奔腾的斑马鱼
- Society for Neuroscience - Hox Genes and Birth Defects
- A brief overview of Hox genes
参见
参考来源
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